V rámci zveřejňování dat z Národního registru hrazených zdravotních služeb (NRHZS) a Informačního systému infekční nemocí vznikla datová sada přinášející informace průběhu epidemie COVID-19 v České republice ve formě anonymizovaných dat. Datová sada umožňuje hodnotit epidemiologické charakteristiky COVID-19 v populaci České republiky od roku 2020, včetně incidence, prevalence a mortality. Uživatelé mohou stratifikovat údaje podle demografických charakteristik pacientů, jako je pohlaví a věk, a hodnotit počty pacientů léčených v akutní lůžkové péči, včetně detailů o průběhu infekce, symptomech, typech testů, očkování a hospitalizacích. Parametry datové sady zahrnují pořadí infekce, pohlaví, kategorii roku narození, týden detekce nákazy, týden výsledku testu, týden vyléčení, týden úmrtí, symptomy, typ testu, týdny očkování (první až sedmá dávka), druhy očkovacích látek, detaily hospitalizace (včetně JIP, kyslíku, HFNO, UPV/ECMO), a další relevantní údaje jako DCCI index a Long COVID. Datová sada obsahuje také informace o osobách, které do kontaktu s COVID-19 nepřišly. Tyto osoby pak nemají vyplněné datum pozitivity ani očkování proti COVID-19. Datová sada vzniká v souladu s národní metodikou tvorby otevřených dat a je dostupná v národním katalogu.
Datová sada podle krajů ČR obsahující denní přehledy změn volných kapacit v nemocnicích akutní péče (celkové počty dostupných přístrojů a lůžek společně s volnými kapacitami v jednotlivých dnech) v souvislosti s šířením nákazy onemocnění COVID-19. Datová sada obsahuje přehledy o přístrojové technice (ECMO, UPV, CRRT, IHD, ventilátory - přenosné a operační sál) a obsazenosti lůžek (pouze lůžka za ARO JIP dospělí a standardní lůžka s kyslíkem za celou nemocnici). Pravidelně jsou aktualizovaná lůžka, která umožňují poskytování daného typu péče, tj. mají nezbytný personál a odpovídající materiálně technické zabezpečení. Definování nezbytného počtu personálu pro daný typ lůžka se může mezi jednotlivými nemocnicemi lišit. Data jsou dostupná od 1. září 2020 do 25. března 2021. Od 29. března je publikována nová otevřená datová sada, kde budou uvedeny aktuálně sledované kapacity.
Datová sada poskytuje řádková data o vykázaných očkováních v ČR. Každý řádek přehledu popisuje množství vykázaných očkování v daném kraji a ORP s použitím dané dávky očkovací látky u konkrétní věkové skupiny a pohlaví.
Stručný náhled na základní epidemiologická data o pandemii COVID-19 v ČR. Datová sada obsahuje aktuální kumulativní počet provedených PCR a antigenních testů (včetně informace za předchozí den), potvrzené případy celkem a ve věkové skupině 65+(včetně informace za předchozí den), aktivní případy (včetně reinfekcí), vyléčené, úmrtí, očkování a hopitalizované pacienty.
Datová sada obsahuje počet osob s prokázanou nákazou (včetně reinfekcí) dle rozdělení do jednotlivých věkových kategorií. Každý řádek udává souhrnné údaje osob v daný týden a v dané věkové kategorii rozdělených do skupin podle stavu očkovanosti: bez očkování, s nedokončeným očkováním, s dokončeným očkováním nebo s dokončeným očkováním včetně posilující dávky.
Datová sada obsahuje počet nově hospitalizovaných osob dle rozdělení do jednotlivých věkových kategorií. Každý řádek udává souhrnné údaje osob v daný týden a v dané věkové kategorii rozdělených do skupin podle stavu očkovanosti: bez očkování, s nedokončeným očkováním, s dokončeným očkováním nebo s dokončeným očkováním včetně posilující dávky.
Datová sada obsahuje počet nově hospitalizovaných osob na jednotce intenzivní péče (JIP) dle rozdělení do jednotlivých věkových kategorií. Každý řádek udává souhrnné údaje osob v daný týden a v dané věkové kategorii rozdělených do skupin podle stavu očkovanosti: bez očkování, s nedokončeným očkováním, s dokončeným očkováním nebo s dokončeným očkováním včetně posilující dávky.
Datová sada obsahující záznamy o vyléčených po onemocnění COVID‑19 dle hlášení krajských hygienických stanic. S ohledem na fakt, že vykazování vyléčených osob má určité zpoždění oproti reálnému stavu z důvodu validace a uzavírání případů krajských hygienických stanic, se mohou denní záznamy zpětně měnit právě z důvodu průběžného doplňování.
Datová sada poskytuje řádková data o vykázaných očkováních na jednotlivých očkovacích místech ČR. Každý řádek přehledu popisuje jedno vykázané očkování v daném dni a indikační skupině profese, s použitím dané dávky očkovací látky, na konkrétním očkovacím místu a ve vybraném kraji. Datová sada obsahuje také informaci o pořadí dávky (první, druhá nebo posilující dávka) a informaci o ukončující dávce, která určuje, zda osoba, které odpovídá vykázané očkování (bez ohledu na pořadí dávky), obdržela ukončující dávku.
Datová sada poskytuje řádková data o vykázaných očkováních na jednotlivých očkovacích místech ČR. Každý řádek přehledu popisuje jedno vykázané očkování v daném dni a věkové skupině, s použitím vybrané očkovací látky, na konkrétním očkovacím místu a ve vybraném kraji.
Datová sada poskytuje agregovaná data o vykázaných očkováních na úrovni krajů ČR. Každý řádek přehledu popisuje počet vykázaných očkování v daném dni, za věkovou skupinu, s použitím vybrané očkovací látky a ve vybraném kraji. Data jsou aktualizována k času 20.00 h předchozího dne a mohou se zpětně mírně měnit z důvodu průběžného doplňování.
Datová sada obsahuje počet, procento a průměrný věk zemřelých. Každý řádek udává souhrnné údaje osob v daný den rozdělených do skupin podle stavu očkovanosti: bez očkování, s nedokončeným očkováním, s dokončeným očkováním nebo s dokončeným očkováním včetně posilující dávky.
Datová sada obsahující záznamy o úmrtích v souvislosti s onemocněním COVID‑19 dle hlášení krajských hygienických stanic. Zahrnuje úmrtí osob, které byly pozitivně testovány na COVID‑19 (metodou PCR) bez ohledu na to, jaké byly příčiny jejich úmrtí, a k jejichž úmrtí došlo v rámci hospitalizace či mimo ni. S ohledem na fakt, že vykazování úmrtí má určité zpoždění oproti reálnému stavu z důvodu validace a uzavírání případů krajských hygienických stanic, se mohou denní záznamy zpětně měnit právě z důvodu průběžného doplňování.
Datová sada obsahuje přehled spotřeby očkovacích látek (použité a znehodnocené ampulky) proti onemocnění COVID-19 v očkovacích místech v ČR. Každý záznam (řádek) datové sady udává počet použitých a znehodnocených ampulek dané očkovací látky na daném očkovacím místě v daný den.
Datová sada poskytuje přehled volné a maximální kapacity očkovacích míst v jednotlivých dnech podle informací z centrálního rezervačního systému na očkování proti onemocnění COVID-19 (https://reservatic.com/ockovani). Každý záznam (řádek) datové sady udává volnou a maximální kapacitu daného očkovacího místa v daný den.
Datová sada obsahující denní přehled suspektních případů reinfekcí COVID-19, které jsou v souladu s doporučením ECDC určeny na základě nově pozitivního PCR testu s minimálním odstupem 60 dnů od předchozí potvrzené pozitivity a nejsou zahrnuty v souhrnném počtu potvrzených případů. Suspektní případy jsou následně validovány a hlášeny do mezinárodní databáze.
Datová sada poskytuje přehled vytvořených registrací v centrálním rezervačním systému na očkování proti onemocnění COVID-19 ( https://registrace.mzcr.cz/ ). Záznamy (řádky) datové sady popisují jednotlivé anonymizované registrace, které byly vytvořeny na dané očkovací místo v daný den. Do datové sady spadají také osoby, které již byly očkovány. Registrovaná osoba je definována tak, že spadá do jedné s následujících skupin: (i) osoba je registrovaná a čeká na přidělení možnosti výběru termínu očkování, (ii) osoba obdržela možnost výběru termínu očkování, (iii) osoba provedla výběr termínu a má tedy rezervaci. Popis procesu rezervace a registrace: (1) Osoba se registruje v centrálním rezervačním systému na očkování. (2) Probíhá proces ztotožnění proti centrálnímu registru obyvatel. (3) Po ověření totožnosti čeká osoba na přidělení možnosti výběru termínu (stav před závorou). (4) Po přidělení možnosti výběru termínu si osoba vybírá vhodný termín (stav za závorou). (5) Po výběru termínu má daná osoba provedenou rezervaci termínu na očkování. (6) Po provedení očkování zůstává záznam v datové sadě s blokovanou registrací (zablokovano = ANO) a současně je uveden důvod blokace (blokace_duvod = Ztotožněn, ale již vakcinován).
Datová sada obsahující denní počty provedených testů s rozlišením na PCR testy a antigenní testy na onemocnění COVID-19 dle hlášení laboratoří. Dále jsou v sadě uvedeny počty testů dle indikace (diagnostické indikace, epidemiologické indikace, preventivní a plošné testování, ostatní), pozitivní záchyty dle indikace testu a pozitivní záchyty (včetně reinfekcí) dle typu testu (symptomy jsou objektivně vyšetřeny u indikovaných osob, v rámci plošného testování jde o vyjádření subjektivního posouzení testovaného). Zdrojem dat je centrální Informační systém infekčních nemocí (ISIN). Primární data byla analyticky zpracována a následně transformována do podoby publikovatelné online týmem ÚZIS ČR.
Datová sada obsahující denní počty provedených testů s rozlišením na PCR testy a antigenní testy na onemocnění COVID-19 dle hlášení laboratoří s rozdělením na kraje ČR. Dále jsou v sadě uvedeny počty testů dle indikace (diagnostické indikace, epidemiologické indikace, preventivní a plošné testování, ostatní), pozitivní záchyty dle indikace testu a pozitivní záchyty (včetně reinfekcí) dle typu testu (symptomy jsou objektivně vyšetřeny u indikovaných osob, v rámci plošného testování jde o vyjádření subjektivního posouzení testovaného).
Datová sada poskytuje řádková anonymizovaná data o osobách s provedeným očkováním včetně informace o prokázané nákaze SARS-CoV-2. Každý řádek přehledu uvádí detailní popis osoby (datum první, druhé nebo posilující dávky, datum dokončeného očkování) podle bydliště očkované osoby, věkové kategorie a očkovací látky. V sadě jsou uvedeny stavy před a po očkování z pohledu indikace testu, pozitivity, hospitalizace a léčby na jednotce intenzivní péče (JIP) s onemocněním COVID-19. Hraniční datum pro definici očkování je vždy 14 dní po datu dokončení očkování.
Datová sada obsahuje počet, procento a průměrný věk osob nad 65 let s prokázanou nákazou včetně reinfekcí. Každý řádek udává souhrnné údaje osob v daný den rozdělených do skupin podle stavu očkovanosti: bez očkování, s nedokončeným očkováním, s dokončeným očkováním nebo s dokončeným očkováním včetně posilující dávky.
Datová sada obsahuje počet, procento a průměrný věk všech osob s prokázanou nákazou včetně reinfekcí. Každý řádek udává souhrnné údaje osob v daný den rozdělených do skupin podle stavu očkovanosti: bez očkování, s nedokončeným očkováním, s dokončeným očkováním nebo s dokončeným očkováním včetně posilující dávky.
Datová sada obsahující počty potvrzených případů (včetně reinfekcí) za posledních 7 a 14 dní za okresy ČR včetně přepočtu na 100 000 obyvatel. Pro přepočet na 100 000 obyvatel je použita otevřená datová sada Obyvatelstvo podle pětiletých věkových skupin a pohlaví v krajích a okresech (https://www.czso.cz/csu/czso/obyvatelstvo-podle-petiletych-vekovych-skupin-a-pohlavi-v-krajich-a-okresech).
Datová sada obsahující počty potvrzených případů (včetně reinfekcí) za posledních 7 a 14 dní za kraje ČR včetně přepočtu na 100 000 obyvatel. Pro přepočet na 100 000 obyvatel je použita otevřená datová sada Obyvatelstvo podle pětiletých věkových skupin a pohlaví v krajích a okresech (https://www.czso.cz/csu/czso/obyvatelstvo-podle-petiletych-vekovych-skupin-a-pohlavi-v-krajich-a-okresech).
Datová sada obsahující základní denní incidenční přehled osob s prokázanou nákazou COVID-19 včetně reinfekcí dle hlášení krajských hygienických stanic včetně laboratoří (datum hlášení, věk a pohlaví nakažené osoby, KHS, informace o místě a zemi nákazy, nahlášeno na krajskou hygienickou stanici).