Vyhledávání datových sad

Datová sada obsahující kumulativní a přírůstkové počty osob s prokázaným onemocněním COVID-19 dle hlášení krajských hygienických stanic včetně laboratoří (s rozdělením na primoinfekce a reinfekce), počty vyléčených po onemocnění COVID‑19 dle hlášení krajských hygienických stanic, počty úmrtí v souvislosti s onemocněním COVID‑19 dle hlášení krajských hygienických stanic a hospitalizačních úmrtí, a počty provedených testů na onemocnění COVID-19 dle hlášení laboratoří. S ohledem na fakt, že vykazování vyléčených osob a úmrtí má určité zpoždění oproti reálnému stavu z důvodu validace a uzavírání případů krajských hygienických stanic, se mohou denní záznamy zpětně měnit právě z důvodu průběžného doplňování.

• CSV

Datová sada obsahující přírůstkové a kumulativní denní počty provedených testů s rozlišením na prvotesty (počet testů v daném dni po korekci na opakované a kontrolní testy) a opakované testy u stejné osoby na onemocnění COVID-19 dle hlášení laboratoří. Prvotesty jsou k dispozici od 1. srpna 2020 z důvodu úplnosti nahlášených dat jednotlivými laboratořemi na individuální úrovni. V předchozím období existuje riziko neúplnosti těchto individuálních dat a proto do 31. července vycházíme pouze z dat agregovaných, která však neumožňují složitější analytické výpočty. Datová sada již není aktualizována a je nahrazena sadou dostupnou na adrese https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/api/v2/covid-19/testy-pcr-antigenni.csv .

• CSV

Datová sada obsahující přírůstkové a kumulativní denní počty provedených PCR testů s rozlišením na prvotesty (počet testů v daném dni po korekci na opakované a kontrolní testy) a opakované testy u stejné osoby na onemocnění COVID-19 dle hlášení laboratoří. Datová sada nahrazuje předchozí verzi dostupnou na adrese https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/api/v1/covid-19/ . Prvotesty jsou k dispozici od 1. srpna 2020 z důvodu úplnosti nahlášených dat jednotlivými laboratořemi na individuální úrovni. V předchozím období existuje riziko neúplnosti těchto individuálních dat a proto do 31. července vycházíme pouze z dat agregovaných, která však neumožňují složitější analytické výpočty.
Datová sada s diagnostickými testy na COVID-19 je od 16. 11. 2020 doplněna dle mezinárodních metodik ECDC, které kalkulují při výpočtu míry (%) pozitivních na počtu testů (test positivity rate) na celkový počet provedených testů RT-PCR ( https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-testing ). Provedené doplnění datových sad reaguje na zahájení testování antigenními testy v ČR a zajišťuje shodu údajů s mezinárodně publikovanými daty, které ČR hlásí podle metodik ECDC do zahraničí. Jako testy určující denní počet nově diagnostikovaných případů jsou nadále uvažovány pouze testy primárně pozitivní.
Zásadním důvodem doplnění datové sady je zahájení testování antigenními testy v ČR, u kterých je opakované vyšetření PCR indikováno jako konfirmační a nelze jej v případě negativního výsledku nezahrnout do centrálních statistik. Datová sada zatím nezahrnuje výsledky samotných antigenních testů, o jejich začlenění bude rozhodnuto na základě mezinárodních doporučení, která budou v brzké době v tomto smyslu aktualizována. Nyní provedená úprava znamená, že do výpočtu indexu rizika 23. 11. 2020 byla zahrnuta 7denní časová řada počtu testů doplněných a odvozených dle výše citované ECDC metodiky, což vede k posunu výsledků míry (%) pozitivních na počtu testů (test positivity rate) oproti indexu rizika z 22. 11. 2020, který započítává pouze testy bez výše uvedených doplnění. Tato změna se promítá i do otevřených datových sad počtu testů umožňujících ruční výpočet indexu rizika.
Datová sada již není aktualizována a je nahrazena sadou dostupnou na adrese https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/api/v2/covid-19/testy-pcr-antigenni.csv .

• CSV

Datová sada obsahující přírůstkové a kumulativní denní počty provedených PCR testů s korekcí na opakovaně pozitivní (kontrolní) testy, a to bez rozdílu způsobu úhrady (tedy včetně samoplátců), na COVID-19 za celou ČR podle hlášení laboratoří (rychlotesty nejsou do přehledu zařazeny). Tento přehled je k dispozici od 1. srpna 2020 z důvodu úplnosti nahlášených dat jednotlivými laboratořemi na individuální úrovni. V předchozím období existuje riziko neúplnosti těchto individuálních dat a proto do 31. července vycházíme pouze z dat agregovaných, která však neumožňují složitější analytické výpočty.

• CSV

Seznam prioritních skupin pro rozdělení očkovaných osob na základě prioritizačního systému Ministerstvem zdravotnictví ČR, který je použit v datové sadě COVID-19: Přehled vykázaných očkování podle profesí (očkovací místo, bydliště očkovaného).

• CSV

Datová sada poskytuje řádková data o vykázaných očkováních v ČR. Každý řádek přehledu popisuje množství vykázaných očkování v daném dni s použitím dané dávky očkovací látky u konkrétního pohlaví a v konkrétní věkové skupině.

• CSV

Datová sada poskytuje agregovaná data o vykázaných očkováních proti onemocnění COVID-19. Každý řádek přehledu uvádí počet osob (s první, druhou a posilující dávkou, s dokončeným očkováním) v daný den rozdělený podle bydliště očkované osoby na úrovni obce s rozšířenou působností (ORP), věkové kategorie a očkovací látky.

• CSV

Datová sada obsahuje denní přehled všech opakovaných infekcí (reinfekcí) onemocněním COVID-19 včetně sedmidenního průměru.

• CSV

Datová sada poskytuje agregovaná data v souvislosti s onemocněním COVID-19. Každý řádek přehledu uvádí počty testů nebo osob (počty provedených testů, nově potvrzené případy nákazy SARS-CoV-2 včetně reinfekcí, nové hospitalizace a nové pacienty na jednotce intenzivní péče) podle věkové kategorie, indikace provedeného testu, dokončeného očkování a předchozí pozitivity.

• CSV

Obsah datové sady na úrovni městských části hlavního města Prahy zahrnuje základní epidemiologické parametry (počty diagnostikovaných osob s COVID-19 včetně reinfekcí, počty aktuálně nakažených včetně reinfekcí), které umožní průběžně sledovat základní epidemiologické ukazatele a vyhodnocovat trendy na pozadí dat publikovaných pro celou ČR. Na základě informací z některých malých obcí eviduje správce systému ISIN problémy s přiřazením bydliště obyvatel. Jde o chybu ztotožňování bydliště v reálném čase u minority případů, kdy není uvedeno bydliště z šetření KHS a jsou dostupná pouze data z laboratoří. Bydliště je správně určeno na úrovni kraje a okresu, ale došlo k chybnému přiřazení osob ke konkrétní obci. Případy podle všeho patří do velkých měst, a drobné obce byly přiřazeny omylem. Dalším problémem může být přiřazení správného trvalého bydliště k dané obci u pacienta, který však v obci nepobývá (pouze je tam přihlášen k pobytu) a jeho diagnóza i léčba probíhá jinde. Správce i provozovatel ISIN děkují vedení obcí za zpětnou vazbu, neboť jinak takové chyby nelze odhalit. Publikování dat na úrovni obcí bylo vedeno snahou o bezbariérový informační servis – tato data jsou nyní ve spolupráci se správou základních registrů zpětně validována. Nejde o chyby velkého rozsahu, nicméně je nutné je dořešit. Pro starosty všech obcí je nově připravený nový internetový dashboard, který umožní rychlou zpětnou kontrolu správnosti.

• CSV

Obsah datové sady zahrnuje základní epidemiologické parametry (počty nově diagnostikovaných osob s COVID-19 včetně reinfekcí, počty aktuálně nakažených včetně reinfekcí) na úrovni obcí ČR. Na základě informací z některých malých obcí eviduje správce systému ISIN problémy s přiřazením bydliště obyvatel. Jde o chybu ztotožňování bydliště v reálném čase u minority případů, kdy není uvedeno bydliště z šetření KHS a jsou dostupná pouze data z laboratoří. Bydliště je správně určeno na úrovni kraje a okresu, ale došlo k chybnému přiřazení osob ke konkrétní obci. Případy podle všeho patří do velkých měst, a drobné obce byly přiřazeny omylem. Dalším problémem může být přiřazení správného trvalého bydliště k dané obci u pacienta, který však v obci nepobývá (pouze je tam přihlášen k pobytu) a jeho diagnóza i léčba probíhá jinde. Správce i provozovatel ISIN děkují vedení obcí za zpětnou vazbu, neboť jinak takové chyby nelze odhalit. Publikování dat na úrovni obcí bylo vedeno snahou o bezbariérový informační servis – tato data jsou nyní ve spolupráci se správou základních registrů zpětně validována. Nejde o chyby velkého rozsahu, nicméně je nutné je dořešit. Pro starosty všech obcí je nově připravený nový internetový dashboard, který umožní rychlou zpětnou kontrolu správnosti.

• CSV

Datová sada poskytuje řádková data o vykázaných očkováních v ČR. Každý řádek přehledu popisuje množství vykázaných očkování v daném dni ve vybraném kraji s použitím dané dávky očkovací látky.

• CSV

Datová sada poskytuje seznam veřejných očkovacích míst v ČR, kde jsou podávány očkovací látky proti onemocnění COVID-19.

• CSV

Datová sada poskytuje seznam očkovacích zařízení v ČR jako doplnění seznamu očkovacích míst, kde jsou podávány očkovací látky proti onemocnění COVID-19. Jedná se především o praktické lékaře, ale i další, kde se očkování provádí.

• CSV

Datová sada poskytuje seznam odběrových míst v ČR, kde jsou prováděny PCR a antigenní testy na onemocnění COVID-19. Součástí publikovaného seznamu nejsou odběrová místa ve zdravotnických zařízeních, kde jsou prováděny testy před přijetím pacienta v souvislosti s poskytováním neodkladné péče. Mobilní odběrové týmy mají kapacitu pevně nastavenu (na hodnotu 20), protože není možné přesně určit tuto kapacitu.

• CSV

Datová sada podle krajů ČR obsahující denní přehledy změn volných kapacit v nemocnicích akutní péče (celkové počty dostupných přístrojů, lůžek a personálu společně s volnými kapacitami v jednotlivých dnech) v souvislosti s šířením nákazy onemocnění COVID-19. Přehled je za období od 11. dubna 2020 do 4. května 2020, kdy docházelo k aktualizaci dat na denní bázi. Poté byla s ohledem na následný stav šíření nákazy onemocněním COVID-19 povinnost aktualizace dat rozvolněna do týdenních intervalů. Datová sada obsahuje přehledy o přístrojové technice (ECMO, UPV, CRRT, IHD), obsazenosti lůžek (pouze lůžka za ARO+JIP dospělí a standardní lůžka s kyslíkem za celou nemocnici) a personálních kapacitách lékařů a sester (pouze za ARO+JIP dospělí).

• CSV

Datová sada podle krajů ČR obsahující denní přehledy změn volných kapacit v nemocnicích akutní péče (celkové počty dostupných přístrojů a lůžek společně s volnými kapacitami v jednotlivých dnech) v souvislosti se šířením nákazy onemocnění COVID-19. Datová sada obsahuje přehledy o přístrojové technice (ECMO, UPV, CRRT, IHD, ventilátory – přenosné a operační sál) a obsazenosti lůžek (pouze lůžka za ARO JIP dospělí a standardní lůžka s kyslíkem za celou nemocnici). Pravidelně jsou aktualizovaná lůžka, která umožňují poskytování daného typu péče, tj. mají nezbytný personál a odpovídající materiálně technické zabezpečení. Definování nezbytného počtu personálu pro daný typ lůžka se může mezi jednotlivými nemocnicemi lišit. Data jsou dostupná od 1. září 2020 do 25. března 2021. Od 29. března je publikována nová otevřená datová sada, kde budou uvedeny aktuálně sledované kapacity.

• CSV

Datová sada podle krajů ČR obsahující denní přehledy změn volných kapacit v nemocnicích akutní péče (celkové počty dostupných přístrojů a lůžek společně s volnými kapacitami v jednotlivých dnech) v souvislosti se šířením nákazy onemocnění COVID-19. Datová sada obsahuje přehledy o následujících parametrech: lůžka (standardní s kyslíkem), lůžka (HFNO/CPAP), lůžka (UPV/NIV), přístroje: ECMO, přístroje: CVVHD, přístroje: ventilátory přenosné, přístroje: anesteziologické přístroje s ventilátorem. Data jsou dostupná od 30. března 2021, kdy byla kompletně spuštěna aktualizace nově sledovaných kapacit. Při aktualizaci dat se vždy zohledňuje primární účel použití daného přístroje a v souladu s tímto účelem se vyplňuje volná kapacita (je-li například lůžko s přístrojem pro UPV, který je vybaven také funkcí HFNO, pak se uvádí do skupiny lůžka (UPV/NIV)). Lůžka se vždy vykazují pouze v kombinaci s daným přístrojem (O2, HFNO, UPV), samostatná evidence těchto přístrojů neuvádí potřebnou informaci pro sledování a plánování kapacit IP.

• CSV

Datová sada podle krajů ČR obsahující denní přehledy změn volných kapacit v nemocnicích akutní péče (celkové počty dostupných lůžek a přístrojů společně s volnými kapacitami v jednotlivých dnech) v souvislosti se šířením nákazy onemocnění COVID-19. Datová sada obsahuje přehledy o následujících parametrech: lůžka (standardní s kyslíkem), lůžka (s možností HFNO), lůžka (s možností UPV), lůžka (infekční oddělení s kyslíkem), lůžka (infekční oddělení s možností HFNO), lůžka (infekční oddělení s možností UPV), přístroje: ECMO, přístroje: CVVHD, přístroje: ventilátory přenosné, přístroje: anesteziologické přístroje s ventilátorem. Data jsou dostupná od 21. října 2021, kdy byla nasazena nová verze webové aplikace Online dispečink intenzivní péče, která obsahuje nové rozdělení na lůžka neinfekční (standardní) a lůžka na infekčních odděleních. Tato změna umožní přesnější sledování a možnosti poskytování specializované péče především v období po epidemii COVID-19 v ČR. Při aktualizaci dat se vždy zohledňuje primární účel použití daného přístroje a v souladu s tímto účelem se vyplňuje volná kapacita (je-li například lůžko s přístrojem pro UPV, který je vybaven také funkcí HFNO, pak se uvádí do skupiny lůžka (s možností UPV). Lůžka se vždy vykazují pouze v kombinaci s daným přístrojem (kyslík, HFNO, UPV), samostatná evidence těchto přístrojů neuvádí potřebnou informaci pro sledování a plánování kapacit IP.

• CSV

Datová sada obsahuje přehled distribuce očkovacích látek proti onemocnění COVID-19 do očkovacích míst v ČR. Každý záznam (řádek) datové sady udává počet ampulek dané očkovací látky, která byla daným očkovacím místem v daný den přijata nebo vydána.

• CSV

Datová sada obsahuje přehled distribuce očkovacích látek proti onemocnění COVID-19 v rámci centrálního skladu (příjem na centrální skladu a výdej do očkovacích míst v ČR). Každý záznam (řádek) datové sady udává počet ampulek dané očkovací látky, která byla daným očkovacím místem v daný den přijata nebo vydána.

• CSV

Datová sada obsahující aktuální přehled o počtech kusů ochranného materiálu k danému dni, který byl distribuován do jednotlivých krajů v ČR (brýle, dezinfekce, roušky, respirátory, ...). Datová sada je dostupná v nové verzi na adrese https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/api/v2/covid-19/ .

• CSV

Datová sada obsahující aktuální přehled o počtech kusů ochranného materiálu k danému dni, který byl distribuován do jednotlivých krajů v ČR (brýle, dezinfekce, roušky, respirátory, ...). Datová sada nahrazuje předchozí verzi dostupnou na adrese https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/api/v1/covid-19/ .

• CSV

Datová sada podle krajů a okresů ČR obsahující kumulativní denní počty osob s prokázaným onemocněním COVID-19 (včetně reinfekcí) dle validovaných hlášení krajských hygienických stanic, kumulativní denní počty vyléčených po onemocnění COVID-19 dle hlášení krajských hygienických stanic a kumulativní denní počty úmrtí v souvislosti s onemocněním COVID-19 dle hlášení krajských hygienických stanic a hospitalizačních úmrtí. S ohledem na fakt, že vykazování vyléčených osob a úmrtí má určité zpoždění oproti reálnému stavu z důvodu validace a uzavírání případů krajských hygienických stanic, se mohou denní záznamy zpětně výrazně měnit právě z důvodu průběžného doplňování. Nedoporučujeme uvádět aktuální počty aktivních případů na základě aktuálních počtů vyléčených osob a úmrtí za poslední dny. Data jsou neúplná a jejich použití má za následek zkreslující výsledky.

• CSV

Obsahem je komplexní přehled základních epidemiologických parametrů (počty diagnostikovaných osob s COVID-19 včetně reinfekcí, počty aktuálně nakažených včetně reinfekcí, hospitalizovaní pacienti) se zaměřením na seniorní zranitelné skupiny obyvatel (kategorie věku 65+, 75+) na geografické úrovni obcí s rozšířenou působností (ORP).

• CSV